توضیحات
فصل اول: مقدمه
مقدمه:
فصل دوم: کلیات و مروری بر مطالعات گذشته.
۲-۱- تاریخچه
۲-۲- طبقه بندی
۲-۳- ساختمان ویریون
۲-۴- ساختمان و سازماندهی ژنوم
۲-۵- تکثیر ویروس
۲-۵-۱- اتصال ورود ، پوشش برداری
۲-۵-۲- پروموترهای ویروسی و تنظیم نسخه برداری
۲-۵-۳ – سرهم بندی و رها شدن ویروس
۲-۵-۴- همانند سازی DNA ویروس
۲-۶- الحاق DNA ویروسی در ژنوم انسان
۲-۷- پروتئین های ویروسی
۲-۷-۱- پروتئین های اولیه E1 تا E6
۲-۷-۲- پروتئین E7
۲-۷-۳- پروتئین های L1 و L2
۲-۸- تیپ بندی پاپیلوماویروس ها
۲-۹- بیماری زایی
۲-۹-۱- عفونت پوستی
۲-۹-۲- عفونت حفره دهانی
۲-۹-۳- عفونت مجاری تنفسی
۲-۹-۴- سرطان مقعد
۲-۹-۵- سرطان گردن رحم
۲-۹-۶- HPV در کودکان
۲-۱۰- اپیدمیولوژی
۲-۱۱- مطالعه سرطان گردن رحم و عفونت پاپیلوماویروس در ایران
۲-۱۲- تشخیص
۲-۱۳- پاسخ ایمنی در برابر HPV
۲-۱۳-۱- ایمنی اختصاصی
۲-۱۳-۱- ۱- پاسخ ایمنی هومورال
۲-۱۳-۱-۲- پاسخ ایمنی سلولی
۲-۱۳-۲-پاسخ ایمنی ذاتی
۲-۱۴- درمان
۲-۱۵- پیشگیری
۲-۱۶- واکسیناسیون
۲-۱۷- واکسیناسیون علیه HPV
۲-۱۷-۱- واکسن های نوترکیب با ناقل زنده
۲-۱۷-۲-واکسن های پروتئینی و پپتیدی
۲-۱۷-۳-ذرات شبه ویروس( VLPs)
۲-۱۷-۴- DNA واکسن ها
-۵-۱۷-۲ واکسن های خوراکی
۲-۱۸- اهمیت پاسخ های ایمنی هومورال و واکسن های پیشگیری کننده
۲-۱۹- اهمیت پاسخ های ایمنی سلولی و واکسن های درمان کننده
۲-۲۰-ایمونوانفورماتیک در علم واکسن
۲-۲۰-۱-ﭘﺎﯾﮕﺎه های داده ها (Databases)
۲-۲۰-۱-۱- پایگاه های داده اﯾﻤﻮﻧﻮﻣﯿﮏ
۲-۲۰-۱-۲- ﭘﺎﯾﮕﺎه داده اپی توپ ها و ﺳﺎﺧﺘﺎرهای آﻧﺘﯽ ﺑﺎدی ﺑﺮای ﺳﻠﻮل B
۲-۲۰-۱-۳- ﭘﺎﯾﮕﺎه داده اﭘﯽ ﺗﻮپ ﺳﻠﻮلT
۲-۲۰-۲-اﺑﺰارها و اﻟﮕﻮرﯾﺘﻢ های ﻣﺘﻨﻮع ﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ
۲-۲۰-۲-۱-ﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ اپی توپ هایﺳﻠﻮل B
۲-۲۰-۲-۲-ﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ اپی توپ هایﺳﻠﻮل B ﺑﺮ ﻣﺒﻨﺎی ﻣﯿﻞ ذاﺗﯽ آﻣﯿﻨﻮاﺳﯿﺪ
۲-۲۰-۲-۳-ﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ اﭘﯽ ﺗﻮپ ﺳﻠﻮلB ﺑﺎ اﺳﺘﻔﺎده از روش های ﯾﺎدﮔﯿﺮی ﻣﺎﺷﯿﻦ
۲-۲۰-۲-۴-روش ﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ اپی توپ هایﻏﯿﺮ پیوسته ﺳﻠﻮل B
۲-۲۰-۲-۵-ﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ اپی توپ های ﺳﻠﻮل T
۲-۲۰-۳- ﮐﺎرﺑﺮدهای ﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ اﭘﯽ ﺗﻮپ
۲-۲۱-واکسن همگانی (Universal vaccine)
۲-۲۲- واکسن سازی معکوس Reverse Vaccinology
۲-۲۳-ادجوانت ها
۲-۲۴-به دست آوردن قطعه DNA یاژن مورد نظر
۲-۲۵-کلونینگ ژن
۲-۲۵-۱- مراحل کلون کردن ژن
۲-۲۵-۲- میزبان کلونینگ
۲-۲۶- آنزیم های محدود کننده
۲-۲۶-۱-آنزیم لیگاز
۲-۲۷- حامل های کلونینگ
۲-۲۸-غربالگری وجود ژن
۲-۲۹-انواع سیستم های بیانی و مزیت اشرشیاکلی
۲-۳۰-وکتورهای بیان کننده
۲-۳۰-۱- وکتورهای بیان کننده سیستمpET
۲-۳۱-وکتورهای پلاسمیدی
۲-۳۲-توالی شاین دلگارنو(SD)(Shine-delgarno)
۲-۳۳-استراتژی بیان در سیستمpET
۲-۳۴-نقشه و مشخصات وکتورpET28a(+)
۲-۳۵-تولید پروتئین نوترکیب
۲-۳۶-مراحل تهیه یک پروتئین نوترکیب در اشرشیاکلی
۲-۳۷-بیان ژن و تولید پروتئین نوترکیب در E.coli
۲-۳۸-راهکارهای افزایش تولید پروتئین نوترکیب در اشرشیاکلی
۲-۳۹-تخلیص پروتئین نوترکیب
۲-۴۰- فرضیات و هدف از انجام تحقیق
۲-۴۰-۱ -فرضیات
۲-۴۰-۲ – هدف از انجام تحقیق
فصل سوم: مواد و روش ها
۳-۱-مجموعه توالی های پروتئین
۳-۲-پیش بینی اپی توپ سلول B
۳-۳-قابلیت دسترسی اپی توپ به حلال
۳-۴-محل های N-Glycosylated
۳-۵-ترجمۀ معکوس اولین ساختمان
۳-۶-بهینه سازی کدون، تعیین کدون های نادر (rare codon)
۳-۷-تولید ساختار واکسن
۳-۸-تهیه باکتری مستعد شده
۳-۹-ترانسفورم نمودن پلاسمید بیانی
۳-۱۰- SDS-PAGE
۳-۱۱-بیان پروتئین نوترکیب HPV واکسن کاندید چند اپی توپی در مقیاس کم
۳-۱۲-کشت انبوه سویه بیانی و تهیه جسم سلولی
۳-۱۳-بیان پروتئین نوترکیب HPV واکسن کاندید چند اپی توپی در مقیاس بالا
۳-۱۴-الکتروفورز پروتئین در ژل آکریل آمید در حضور SDS
۳-۱۵- رنگ آمیزی ژل با کوماسی بلوR-350
۳-۱۵-۱- روش تهیه محلول ها
۳-۱۵-۲- روش رنگ آمیزی
۳-۱۶- وسترن بلاتینگ
۳-۱۶-۱- انتقال در تانک
۳-۱۶-۲- مسدودسازی غشا
۳-۱۶-۳- تشخیص با آنتی بادی
۳-۱۷-تخلیص پروتئین با یون های نیکل متصل به ماتریکس NTA نوترکیب HPV واکسن کاندید چند اپی توپی روی ماتریکس Ni-NTA
۳-۱۸-بهینه سازی تخلیص
۳-۱۹-ارزیابی پروتئین تخلیص شده با روش SDS-PAGE
۳-۲۰-تخلیص انبوه پروتئین نوترکیبHPV واکسن کاندید چند اپی توپی
۳-۲۱- دیالیز و تغلیظ پروتئین HPV واکسن کاندید چند اپی توپی تخلیص شده
۳-۲۲- ارزیابی پروتئین تخلیص شده
۳-۲۳- روش برادفورد
۳-۲۳-۱- طرز تهیه محلول های مورد نیاز
۳-۲۳-۲- طرز تهیه محلول برادفورد
۳-۲۳-۳- طرز تهیه محلول استاندارد پروتئین ذخیره با غلظت ۱۰۰۰μic/ml
۳-۲۳-۴- طرز تهیه محلول استاندارد پروتئین با غلظت ۱۰,۱۰۰mic/ml
۳-۲۴- بررسی خلوص پروتئین نوترکیب HPV واکسن کاندید چند اپی توپی تخلیص شده با روش SDS-PAGE
۳-۲۵-بررسی پروتئین نوترکیب HPV واکسن کاندید چند اپی توپی تخلیص شده با وسترن بلات
۳-۲۶-پروتئین نوترکیب HPV واکسن کاندید چند اپی توپی
۳-۲۷- حیوان آزمایشگاهی
۳-۲۸-ادجوانت فروند ناقص
۳-۲۹-گروه‌های تجربی و واکسیناسیون موش‌ها
۳-۳۰- بررسی پاسخ های همورال
۳-۳۰-۱- بررسی سطح آنتی بادی توتال در رقت های مختلف سرمی
فصل چهارم: نتایج
۴-۱-پیش بینی اپی توپ سلول B
۴-۲- قابلیت دسترسی اپی توپ ها
۴-۳-محل های N-Glycosylated
۴-۴-انتخاب اپی توپ ها و اتصال پپتیدها برای تولید ساختمان واکسن
۴-۵-ارزشیابی توالی پروتئین
۴-۶-ترجمۀ معکوس ساختمان اول
۴-۷-نتایج تایید بیان پروتئین نوترکیب HPV واکسن کاندید چند اپی توپی با روش SDS-PAGE
۴-۸- نتایج تایید بیان پروتئین نوترکیب HPV واکسن کاندید چند اپی توپی با روش وسترن بلاتینگ
۴-۹-نتایج بررسی پاسخ های ایمنی همورال
۴-۹-۱- نتایج بررسی سطح آنتی‌بادی توتال اختصاصی واکسن کاندید
فصل پنجم: بحث و نتیجه گیری..
۵-۲-پیشنهادات و چشم اندازها
نقد و بررسی‌ها
هنوز بررسی‌ای ثبت نشده است.